สารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพระดับสูง (high level disinfectant) สามารถทำลายเชื้อจุลชีพได้เกือบทุกชนิด รวมถึงสปอร์ของเชื้อแบคทีเรีย สารฆ่าเชื้อกลุ่มนี้ได้แก่ Glutaraldehyde, ortho-Phthalaldehyde (OPA), Peracetic Acid (PAA), Hydrogen Peroxide (H2O2), Chlorine gas (Cl2), Hypochlorous Acid (HOCl), Chlorine Dioxide (ClO2) และ Sodium Hypochlorite (NaOCl) เป็นต้น
