สารฆ่าเชื้อแบ่งตามระดับประสิทธิภาพการทำลายมี 3  ระดับ

สารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพระดับสูง  (high level disinfectant) , สารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพระดับปานกลาง (intermediate level disinfectant) , สารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพระดับต่ำ  (low level disinfectant)